أُسِّست جامعة كركوك في 17 كانون الثاني 2003، وبدأت مسيرتها الأكاديمية بأربع كليات هي: القانون، التربية للعلوم الإنسانية، العلوم، والتمريض.

ومع ازدياد الحاجة إلى الخبرات العلمية في المحافظة، استحدثت الجامعة ثلاث كليات جديدة: الطب والهندسة والزراعة، تبعتها كلية الإدارة والاقتصاد عام 2007–2008، ثم كلية التربية للعلوم الصرفة عام 2011–2012.

وشهدت الجامعة لاحقاً نقلة نوعية واسعة شملت استحداث كليات وأقسام علمية وإنسانية جديدة، منها: الطب البيطري والتربية البدنية وعلوم الرياضة، إضافة إلى افتتاح برامج دراسات عليا (الماجستير) في الفيزياء، علوم الحياة، علوم الأرض، الكيمياء، القانون، اللغة العربية، والبستنة في كلية الزراعة، وبرنامج الدكتوراه في كلية القانون وقسم اللغة العربية ضمن كلية التربية للعلوم الإنسانية.

وبعد انتقال الجامعة إلى موقعها الجامعي الجديد في الصيادة، توسعت الكليات لتشمل كلية طب الأسنان وكلية الآداب، إضافة إلى استحداث كلية للتربية وأخرى للزراعة في قضاء الحويجة، وكذلك استحداث كلية علوم الحاسوب وتكنولوجيا المعلومات.

وبهذه الخطوات المتتابعة، تواصل جامعة كركوك تعزيز حضورها الأكاديمي وتطوير برامجها العلمية، لتكون رافداً أساسياً للخبرات والكفاءات في المحافظة والعراق عامة.