تعتبر شعبة الدراسات العليا من الشعب المهمة في الكلية لما لها من دور مهم في رفد المسيرة العلمية للكلية والجامعة بل وللمجتمع بصورة عامة وبقطاعيه العام والخاص
ومن نشاطات شعبة الدراسات العليا عمل خطة قبول واستقبال وتدقيق ملفات المتقدمين للدراسات العليا وتصدير الاوامر الادارية بالطلبة المقبولين ومباشرتهم ومتابعة ملفاتهم وكذلك اصدار الاوامر الادارية بالتمديد الاولي والثاني وارسال جداول الامتحانات والمواقف اليومية لامتحانات الفصل الدراسي الاول والثاني وارسال الكتب لتسهيل المهمات الى الجهات المختلفة لانجاز الجزء العملي لرسالة الماجستير ومنح كتب التاييد للجهات المطلوبة واصدار الاوامر الادارية الخاصة بمواعيد المناقشة وتهيئة ملفات الطلبة ليوم المناقشة لحين صدور الاوامر الجامعية بمنح الشهادة واصدار وثائق التخرج باللغتين العربية والانكليزية بالدرجات وبدون درجات ومتابعة ملفات المنتسبين المجازين دراسيا لدراسة الماجستير والدكتوراه داخل وخارج العراق وعمل تقرير سنوي واحصاء جامعي للطلبة المقبولين والذين هم في المرحلة التحضيريةوالبحث والمرقنة قيودهم والمتخرجين من الكلية
تم استحداث دراسةالماجستير لاول مرة في كلية العلوم في العام الدراسي 2010-2011 في قسم علوم الحياة ، كما وتوالت عملية استحداث الدراسات العليا في جميع اقسام الكلية عدا قسم الرياضيات وحاليا هناك لقائات ومراسلات تجري بين الكلية والوزارة لاستحداث دراسة الماجستير في قسم الرياضيات وباشراف مباشر من قبل رئاسة جامعة كركوك ومن المحتمل ان يتم الاستحداث في العام الدراسي 2023-2024
ومما يجدر الاشارة اليه ان قسمي علوم الحياة وقسم الكيمياء تم استحداث دراسة الدكتوراه في هذين القسمين منذ العام 2020 بالاضافة الى دراسة الماجستير