تعمل شعبة الرقابة والتدقيق الداخلي على مراقبة التوجيهات والسياسات الجامعية والمؤسسية، فضلًا عن ضمان الامتثال للقوانين والتشريعات المحلية والدولية وتوجيهات الجودة والتقييم الخارجي، كما تسعى أيضاً إلى تحسين العمليات الادارية الداخلية وتقديم التوصيات لتحسين الأداء الإداري.
وتتمثل مهام شعبة الرقابة والتدقيق الداخلي أيضاً في تقييم النتائج الأكاديمية والإدارية ومراجعة العمليات المالية والإدارية والتأكد من سلامة الإجراءات المالية والمحاسبية.
إن شعبة الرقابة والتدقيق الداخلي هي جزء أساسيّ من البنية التحتية الإدارية في الكلية، إذ تسهم في تعزيز الجودة والتحسين المستمر والامتثال للقوانين والتشريعات والضمانات المؤسسية والجودة التعليمية.