تم استحداث وحدة البحوث البيئية بحسب الأمر الوزاري في سنة 2005 وذلك انطلاقاً من مبدأ الاهتمام بالبيئة من خلال تفعيل آلية التعاون المشترك مع جميع الدوائر ذات العلاقة في محافظة كركوك خدمة للمواطن العراقي في رفد الجامعة بالمشاريع البيئية التي تعنى بالوقوف على أهم المشاكل البيئية التي يواجها البلد في شتى المجالات المتنوعة.
بفضل توفر عدد كبير ومتنوع من الأجهزة البحثية المتقدمة والحديثة، تعتبر وحدة البحوث البيئية من الوحدات البحثية المتخصصة ببحوث طلبة الدراسات العليا والباحثين، وبإمكانها التعاون مع مختلف الجامعات العراقية لما تمتلكها الوحدة من إمكانات في هذا المجال. على الرغم من الظروف الاقتصادية التي مرت وتمر بالبلاد، قامت الوحدة ولا تزال تقوم بدور رائد في النشاطات البيئية المتنوعة من خلال إقامة الندوات البيئية والأنشطة والفعاليات البيئية المتنوعة الخاصة بنشر الوعي البيئي إضافة إلى التعاون مع دوائر المحافظة، كدوائر البيئة، الصحة، الموارد المائية، الزراعة، البيطرة، شركة نفط الشمال وشركة غاز الشمال...الخ من الدوائر ذات العلاقة.
منذ تشكيلها قبل 15 سنة، تم تجهيز وحدة البحوث البيئية بمختلف الأجهزة الحديثة ومن المناشيء العالمية وذلك تنفيذاً لما يتطلبه الأمر للقيام بالمهام الموكلة إلى الوحدة. وقد تناوب عدد من الأساتذة على إدارة الوحدة، حيث استلم إدارة الوحدة الأستاذ الدكتور محمد عبدالعزيز قادر ومن ثم انتقلت الإدارة إلى الأستاذ الدكتورة أواز بهروز محمد إلى تأريخ 16/10/ 2016، وبعدها انتقلت الإدارة إلى الأستاذ الدكتور عمر صباح إبراهيم بتأريخ 17/10/2016 إلى 29/8/2019. وبعد هذا التأريخ ولحين إعداد هذه النبذة استلم الدكتور عبدالامير حسين قاسم إدارة الوحدة.
وبحسب توجيهات السيد رئيس جامعة كركوك الأستاذ الدكتور صباح احمد إسماعيل والسيد عميد كلية العلوم الأستاذ المساعد نعمة علي احمد، تم التركيز بشكل كبير على تشغيل الأجهزة المختبرية والتي بقت لسنوات عديدة دون تشغيل، علماً أنها كلفت الدولة مبالغ كبيرة. وبعد النجاح في تشغيل تلك الأجهزة وبجهود استثنائية مدير الوحدة وكوادرها، أصبحت الوحدة قادرة على تحقيق أهدافها المرسومة لها وبما يخدم الواقع البيئي لمحافظة كركوك.