تم استحداث وحدة البحوث البيئية بحسب الأمر الوزاري في سنة 2005 وذلك انطلاقاً من مبدأ الاهتمام بالبيئة من خلال تفعيل آلية التعاون المشترك مع جميع الدوائر ذات العلاقة في محافظة كركوك خدمة للمواطن العراقي في رفد الجامعة بالمشاريع البيئية التي تعنى بالوقوف على أهم المشاكل البيئية التي يواجها البلد في شتى المجالات المتنوعة.

بفضل توفر عدد كبير ومتنوع من الأجهزة البحثية المتقدمة والحديثة، تعتبر وحدة البحوث البيئية من الوحدات البحثية المتخصصة ببحوث طلبة الدراسات العليا والباحثين، وبإمكانها التعاون مع مختلف الجامعات العراقية لما تمتلكها الوحدة من إمكانات في هذا المجال. على الرغم من الظروف الاقتصادية التي مرت وتمر بالبلاد، قامت الوحدة ولا تزال تقوم بدور رائد في النشاطات البيئية المتنوعة من خلال إقامة الندوات البيئية والأنشطة والفعاليات البيئية المتنوعة الخاصة بنشر الوعي البيئي إضافة إلى التعاون مع دوائر المحافظة، كدوائر البيئة، الصحة، الموارد المائية، الزراعة، البيطرة، شركة نفط الشمال وشركة غاز الشمال...الخ من الدوائر ذات العلاقة.